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後天性門體分流為因長期門脈高壓導致的多發性門體側枝血管（multiple acquired portosystemic collaterals, MAPSC）開放。常見原因為慢性肝病（肝硬化、肝纖維化）、門脈血栓或先天性門脈發育不良。與先天性 PSS 不同，後天性分流為多發性且反映嚴重的基礎肝臟疾病。
急性肝衰竭為肝臟功能在短時間內（數天至數週）急速惡化的危急狀態，常見原因包括藥物中毒（Xylitol、Acetaminophen、NSAID）、毒素攝入（Amanita mushroom、Sago palm）、感染性肝炎與缺血性損傷。臨床表現為黃疸、凝血障礙、肝性腦病與多器官衰竭。
黃麴毒素肝病是由黃麴黴菌 (Aspergillus flavus/parasiticus) 產生的黃麴毒素汙染食物引起的肝臟中毒性疾病。犬對黃麴毒素極度敏感，攝入汙染飼料可導致急性肝衰竭。
禽類鐵質沉著症（Iron Storage Disease, ISD）為過量鐵質沉積於肝臟與其他器官導致的代謝性疾病，主要影響巨嘴鳥、椋鳥、天堂鳥等軟食性鳥類，造成肝臟纖維化與功能衰竭。
禽類肝臟疾病涵蓋脂肪肝症候群、肝炎、肝纖維化及肝腫瘤等多種病變。鸚鵡類以脂肪肝（肝脂肪變性）最為常見，多因高脂肪飲食與缺乏運動所致。臨床表現常隱匿，發現時可能已有嚴重肝損傷。
膽管阻塞是指肝外或肝內膽管因各種原因導致膽汁流通受阻的疾病。常見原因包括胰臟炎、膽石症、腫瘤和炎症性膽管病變。阻塞性黃疸是主要臨床表現。
膽道阻塞（又稱阻塞性膽管疾病）是指膽汁從肝臟經膽管系統排入十二指腸的通路被部分或完全阻斷的病況。原因包括胰臟炎、膽管結石、腫瘤、膽囊黏液囊腫及嚴重十二指腸炎等，導致膽汁淤滯、黃疸及進行性肝損傷。
膽管炎是指膽管系統的炎症性疾病，為貓隻最常見的肝膽疾病。依據組織病理學分為嗜中性球性膽管炎（急性，常伴細菌感染）、淋巴球性膽管炎（慢性，可能為免疫媒介性）及慢性膽管炎伴肝吸蟲感染。貓隻膽管炎常與胰臟炎及炎症性腸病合併發生，稱為「三合一症候群」（triaditis）。
膽囊炎為膽囊壁的炎症反應，犬貓可為急性或慢性。常與膽結石、膽囊黏液囊腫（gallbladder mucocele）、膽道感染或膽管阻塞相關。犬隻膽囊黏液囊腫合併膽囊炎為重要的急腹症。細菌性膽囊炎以 E. coli、Enterococcus spp. 最常見。
膽結石為膽囊或膽管內形成結石的疾病。犬隻膽結石多為膽色素結石（bilirubin stones），貓隻亦可見。多數膽結石為偶發性影像學發現，無臨床症狀。但膽結石可能導致膽管阻塞、膽囊炎或膽囊破裂等嚴重併發症。
慢性肝炎是指肝臟持續性發炎超過數週至數月的疾病，組織病理學上以肝細胞壞死、淋巴漿細胞浸潤及不同程度的纖維化為特徵。為犬隻最常見的慢性肝臟疾病之一，多數病因不明（特發性），但部分與銅蓄積、藥物、感染或免疫介導機制有關。
肝硬化為慢性肝臟疾病的終末期，以瀰漫性纖維化、再生結節形成與正常肝臟結構破壞為特徵。為不可逆性病變。犬隻常見原因為慢性肝炎（特發性、銅蓄積性、免疫介導性）。臨床上表現為門脈高壓、肝功能不全與後天性門體分流。
先天性門體分流（congenital PSS）為先天性血管異常，門脈血液繞過肝臟直接流入體循環（後腔靜脈或奇靜脈），導致肝臟發育不良與毒素（氨、芳香族胺基酸）蓄積。犬隻好發品種包括 Yorkshire Terrier、Maltese、Miniature Schnauzer（肝外型）與大型犬（肝內型）。
銅儲積性肝病是指銅在肝細胞中異常蓄積而導致肝臟損傷的疾病。可為原發性（遺傳性銅代謝缺陷）或繼發性（膽汁鬱滯導致銅排出障礙）。犬隻中以貝靈頓㹴的遺傳性銅中毒最具代表性，但近年來多種品種的銅相關肝病報告顯著增加。
銅相關性肝炎是由肝臟銅蓄積導致的慢性進行性肝炎。銅蓄積可能為原發性遺傳缺陷（如 Bedlington Terrier 的 COMMD1 基因突變導致銅排泄障礙）或繼發於膽汁排泄障礙（膽汁鬱積導致銅排出減少）。過量的銅在肝細胞中蓄積，引起氧化損傷、細胞壞死和慢性發炎反應，最終可能進展為肝硬化和肝衰竭。近年來研究顯示，除了已知的遺傳性品種外，許多犬品種的銅相關性肝病發病率有增加趨勢，可能與商業飼料中銅含量偏高有關。
杜賓犬品種特異性慢性肝炎,多為銅蓄積性肝病或免疫介導性肝炎。可進展為肝硬化與肝衰竭。中年母犬較常見。
肝外膽道疾病涵蓋影響膽囊、膽囊管、總膽管及十二指腸乳頭的各種病變，包括膽石症、膽囊炎、膽管炎及膽道腫瘤等。是犬貓阻塞性黃疸的重要原因。
貓三合一症 (Triaditis) 是膽管炎、胰臟炎與炎性腸病 (IBD) 同時存在的複合疾病。三者的解剖學關聯（總膽管與胰管在十二指腸乳頭合流）使其在貓中特別常見且相互影響。
膽囊黏液囊腫是由膽囊黏膜上皮細胞過度分泌黏液導致膽囊內異常黏液蓄積、膽囊膨脹的疾病。為犬隻重要的膽道疾病，可導致膽囊壁壞死、破裂及膽汁性腹膜炎，具潛在致命性。近年來發生率有明顯上升趨勢。
膽囊破裂是指膽囊壁完整性喪失導致膽汁滲漏至腹腔的急性外科疾病。最常見的原因是膽囊黏液囊腫壞死或膽囊炎。膽汁性腹膜炎可迅速危及生命。
倉鼠多囊肝是一種以肝臟內出現多發性、充滿液體的囊腫為特徵的肝膽疾病，源於胚胎期膽管板發育異常（ductal plate malformation），好發於老年敘利亞倉鼠，且肝囊腫的發生遠較腎囊腫常見。多數患鼠在囊腫體積尚小時無明顯症狀，常於理學檢查、影像或解剖時偶然發現；當囊腫顯著增大壓迫正常肝實質與膽道時，可出現肝臟腫大、腹部膨脹、食慾下降與黃疸。本病屬結構性（非感染性）病變，治療以監測及對有症狀的大型囊腫進行減壓或切除為主，並針對失代償的肝功能異常給予支持療法。
肝臟囊腫是肝臟內充滿液體的囊性病變，可為先天性或後天性。多數為偶然發現的良性病變，但需與膽管囊腺瘤或膿瘍等鑑別。
肝功能嚴重不全導致神經毒素 (主要為氨 ammonia) 無法代謝，蓄積於血液中穿越血腦屏障，造成瀰漫性腦功能障礙。最常見於先天性門脈分流 (portosystemic shunt) 的幼年動物或嚴重肝病的成年動物。
肝纖維化為肝臟對慢性損傷的修復反應，以過度膠原蛋白沉積（collagen deposition）為特徵。為可逆性病理變化（與肝硬化不同），若基礎病因移除可能改善。犬隻常見原因包括慢性肝炎、銅蓄積性肝病與藥物性肝損傷。
肝臟良性血管瘤,罕見於犬貓。通常無症狀,超音波偶發現。與惡性血管肉瘤不同,預後良好。
過量脂肪堆積於肝細胞內導致肝功能障礙的代謝性疾病。貓為最常見罹患物種，肥胖貓在厭食數天後即可快速發展為嚴重肝脂肪變性，為貓最常見的肝臟疾病，未及時治療死亡率極高。
肝臟髓脂瘤是一種罕見的良性腫瘤，由成熟脂肪組織與造血組織組成。通常為偶然影像學發現，臨床意義不大，但需與其他肝臟腫瘤鑑別。
肝臟良性結節性增生,老年犬常見偶發現。多為單發或多發小結節,通常無臨床意義,無需治療。
犬慢性肝炎是以肝臟持續性炎症反應與進行性肝細胞壞死為特徵的疾病，可由多種病因引起，包括銅蓄積、免疫介導、感染性及藥物誘發等。是犬最常見的肝臟疾病之一。
貓慢性肝炎是以肝臟持續性炎症為特徵的疾病，在貓中較犬少見。貓肝臟炎症疾病以膽管炎為主要表現，但亦可見門脈性或小葉性肝炎模式。
肝皮膚症候群（superficial necrolytic dermatitis, SND）為因嚴重肝臟代謝異常導致胺基酸缺乏，進而引起表皮壞死性皮膚病變的罕見疾病。犬隻肝臟超音波呈特徵性「蜂窩狀」（Swiss cheese 或 honeycomb pattern）。皮膚病變好發於足墊、口鼻周圍與壓力點。亦可與胰臟腫瘤（glucagonoma）相關。
肝門脈微血管發育不良 (MVD) 是一種先天性肝臟微血管異常，門脈血流在肝臟微循環層級發生分流。臨床表現類似門體分流但影像學無法偵測到大血管分流。小型犬品種好發。
由Hepatozoon americanum原蟲引起的嚴重血液寄生蟲病,僅見於美國南部。與H. canis不同,造成嚴重肌炎、骨膜炎及極度疼痛,預後較差。
由Hepatozoon canis原蟲經壁蝨攝入傳播的血液寄生蟲病,全球分布。感染通常呈慢性經過,臨床症狀輕微至中度,免疫抑制個體可能出現嚴重併發症。
肝內膽道疾病是指影響肝臟內部膽管系統的病變，包括肝內膽管炎、膽管發育不良、肝內膽石症及膽管纖維化等。在貓中尤其重要，是貓慢性肝病的主要原因之一。
愛爾蘭獵狼犬可能發生先天性肝外或肝內門脈分流,導致血液繞過肝臟直接進入體循環,引起肝性腦病與生長遲緩。
小葉解離性肝炎為一種特殊的犬隻慢性肝炎，以肝小葉結構被纖維組織解離（dissection of hepatic lobules by fibrous tissue）為特徵。多發生於年輕犬（<2 歲），進展迅速，可快速發展為肝硬化與肝衰竭。病因不明，可能與免疫介導機制或感染相關。
淋巴球性膽管炎是以小淋巴球浸潤膽管壁為特徵的慢性肝臟炎症性疾病，可能為免疫介導機制。在貓中是慢性肝病的重要原因，病程緩慢但可進展為膽管纖維化。
肝結節性增生是老年犬隻極為常見的良性肝臟病變，由肝細胞局灶性增殖形成肝臟內多發性結節。此病變為非腫瘤性，臨床上無顯著症狀，但影像學上常與轉移性腫瘤或原發性肝臟腫瘤混淆，須進行組織學確認以避免誤診。
門體分流（PSS）是指門靜脈血液繞過肝臟直接進入體循環的異常血管通道。可為先天性（單一血管異常）或後天性（多發側枝循環）。門靜脈血液未經肝臟代謝，導致毒素（尤其是氨）在體內蓄積，引起肝性腦病、發育遲緩及泌尿道結石等問題。
先天性門體分流（PSS）為異常血管連接門靜脈與全身靜脈系統，使含毒素的門靜脈血液繞過肝臟直接進入全身循環。導致肝臟發育不全與肝性腦病。分為肝外型（小型犬）與肝內型（大型犬）。
由 Eimeria stiedai 引起的兔肝膽管寄生蟲感染，寄生於膽管上皮細胞，導致膽管增生、肝腫大、黃疸。為兔球蟲症中唯一侵犯肝臟的種類，與腸道球蟲症病因不同。
暹羅貓家族性類澱粉樣變性主要影響肝臟（與其他品種貓的腎臟型不同），AA 型類澱粉蛋白沉積於肝臟實質中，可導致自發性肝破裂與致命性腹腔內出血。為暹羅貓及東方短毛貓的重要遺傳性疾病。
化膿性嗜中性球膽管炎是以嗜中性球浸潤膽管壁為特徵的急性或慢性膽管炎症，通常由細菌上行感染引起。在貓中是肝膽疾病的常見類型，與腸道菌群上行感染密切相關。
空泡性肝病為肝細胞內出現過度空泡化（vacuolization）的病理狀態，以肝醣蓄積（glycogen accumulation）為主要類型。犬隻最常見原因為內源性或外源性糖皮質激素過量（腎上腺皮質功能亢進、長期類固醇治療）。為可逆性病變，移除原因後可改善。
約克夏梗肝臟脂肪變性是小型犬因脂肪代謝異常或長時間禁食導致肝細胞內大量脂肪蓄積的疾病。約克夏梗因體型小、肝糖儲備低而特別易感，尤其在厭食或手術禁食後。
約克夏梗門脈系統分流（PSS）是該品種高度好發的先天性血管異常，門脈血液繞過肝臟直接進入全身循環。導致毒素（氨、膽酸等）無法被肝臟代謝，引起肝性腦病與肝臟發育不良。