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急性腎損傷（AKI）指腎絲球過濾率在數小時至數日內急速下降，造成氮血症、電解質與酸鹼失衡及尿量異常的臨床症候群。犬多由葡萄/葡萄乾、乙二醇、NSAIDs 等腎毒素或鉤端螺旋體感染引起，貓則以百合中毒與輸尿管結石阻塞最具代表性。與慢性腎臟病不同，AKI 若能及早移除病因並維持腎臟灌流，腎功能有機會部分甚至完全恢復，屬於必須立即住院介入的可逆性急症。
急性腎損傷（AKI）常見電解質異常包括高血鉀、高血磷、代謝性酸中毒及低血鈣。嚴重高血鉀可導致心律不整致死,需緊急處理。
膀胱壁局部袋狀突出形成囊袋狀結構，可為先天性或後天性，常導致尿液滯留、反覆感染及結石形成。
膀胱壁完全性破裂導致尿液外滲至腹腔或周圍組織，常見於鈍性創傷、骨盆骨折或醫源性損傷，屬於泌尿系統急症。
腎元結構與功能持續喪失達三個月以上且不可逆的疾病，是老年貓最主要的死因之一，中老年犬亦常見。臨床以多尿多渴、體重減輕、食慾下降與氮血症表現，確診後須依 IRIS 分期及蛋白尿、血壓亞分期擬定治療與追蹤計畫；早期偵測並控制高磷血症、蛋白尿與高血壓可明顯延緩進展。
達爾馬提亞犬高尿酸血症是該品種特有的先天性嘌呤代謝異常。因 SLC2A9 基因突變導致肝臟無法將尿酸完全轉化為尿囊素（allantoin），加上腎小管尿酸再吸收增加，導致血液與尿液中尿酸濃度異常升高，易形成尿酸鹽結石。
輸尿管未正確開口於膀胱三角區，而異位開口於尿道、前庭、陰道或子宮等位置的先天性泌尿道異常，為幼犬尿失禁最重要的先天性原因。
貓最常見的下泌尿道疾病，佔貓下泌尿道症狀（FLUTD）病例的55-69%。特徵為無菌性膀胱壁發炎，病因不明但與神經內分泌系統失調和環境壓力密切相關。屬排除性診斷，需先排除感染、結石和腫瘤等已知病因。
局灶節段性腎絲球硬化 (FSGS) 是以部分腎絲球（局灶性）中某些節段（節段性）發生硬化與玻璃樣變性為特徵的腎絲球疾病。可為原發性或繼發於其他腎臟疾病。
腎絲球免疫介導性損傷導致的蛋白尿與進行性腎功能喪失，為犬蛋白流失性腎病 (PLN) 最常見的原因之一。
膜增生性腎絲球腎炎 (MPGN) 是以腎絲球基底膜增厚與系膜細胞增生為特徵的腎絲球疾病。在犬中常與慢性感染或免疫介導疾病相關，導致進行性蛋白尿與腎功能衰退。
膜性腎絲球腎炎是以腎絲球基底膜增厚與免疫複合物沉積為特徵的腎絲球疾病。在犬中是蛋白尿的重要原因之一，可進展為慢性腎病。
天竺鼠鈣代謝異常是指其腸道對鈣的吸收效率高、且不受維生素D與副甲狀腺素有效回饋調控，導致過量的鈣經腎臟以碳酸鈣形式排入尿液所引發的一連串臨床問題。當飼料鈣質過高或鈣磷比例失衡且飲水不足時，持續的高尿鈣造成碳酸鈣結晶、尿砂與膀胱／尿道結石，表現為血尿、排尿困難與（公鼠）尿道阻塞；反之鈣或維生素D攝取不足、或慢性磷過剩時，則導致骨鈣化不足、代謝性骨病變與門齒、臼齒咬合不正。臨床多以食慾下降、排尿疼痛、體重減輕等非特異性徵象就診。
天竺鼠尿道結石是下泌尿道阻塞性疾病，因其特殊鈣質代謝使尿液中碳酸鈣晶體過飽和，結石自膀胱移行嵌頓於狹窄尿道（公鼠尿道細長尤為好發）。典型表現為血尿、用力卻量少的頻尿姿勢、排尿困難與疼痛叫聲；完全阻塞為急症，可在 24-48 小時內進展為腎後性氮血症、高血鉀與膀胱破裂而致命。
天竺鼠泌尿道結石，好發於膀胱與尿道。結石成分多為碳酸鈣，與兔類似但天竺鼠尿道結石較常見（尤其公天竺鼠），可造成尿道阻塞為急症。
倉鼠常見的老年退化性疾病，異常類澱粉蛋白 (amyloid A) 沉積於腎臟、肝臟、脾臟等器官，導致進行性器官功能衰竭，為老年敘利亞倉鼠常見的致死原因之一。
因尿路阻塞導致腎盂與腎盞擴張積水，造成腎實質進行性萎縮與功能喪失。
IgA 腎病是以 IgA 免疫球蛋白沉積於腎絲球系膜區為特徵的腎絲球疾病。在犬中有報告但不如人類常見，表現為血尿和蛋白尿。
微小變化病是一種腎絲球疾病，光學顯微鏡下腎絲球結構正常，僅在電子顯微鏡下可見足細胞足突融合。在犬貓中罕見，以大量蛋白尿和腎病症候群為特徵。
腎臟集合管對抗利尿激素 (ADH/vasopressin) 反應不足，導致大量低滲透壓尿液排出與嚴重多尿多渴的罕見腎臟疾病。
胎兒時期連接膀胱與臍帶的臍尿管出生後未正常閉合,導致尿液從臍部滲出或形成感染,多見於幼齡動物。
腎周圍假性囊腫是腎臟被膜下或腎周圍積聚液體形成的囊性結構，因缺乏真正的上皮內襯而稱為假性囊腫。在貓中較常見，常與慢性腎病相關。
多囊腎病為一種遺傳性腎臟疾病，以腎實質內多發性囊腫進行性擴大為特徵，最終導致腎功能衰竭。在波斯貓及相關品種中最為常見，由 PKD1 基因突變引起，呈體染色體顯性遺傳。
因腎絲球損傷導致大量蛋白質經尿液流失的腎臟疾病，包括腎絲球腎炎與類澱粉沉著症，可進展為腎病症候群與慢性腎臟病。
細菌感染上行至腎盂與腎實質引起的感染性腎臟疾病，為犬貓急性腎損傷與慢性腎臟病的重要可治療原因。
兔膀胱內碳酸鈣結晶沉積形成濃稠泥沙狀沉澱物，為兔獨特鈣代謝的常見後果。介於正常尿液鈣沉澱與結石 (urolithiasis) 之間，可引起排尿困難、血尿及慢性膀胱炎。
兔阻塞性尿石症是以碳酸鈣為主的尿石或濃稠尿砂卡在輸尿管、膀胱頸或尿道造成尿流阻塞的泌尿急症,公兔尿道較長窄故更易完全阻塞。阻塞後上游管腔壓力升高逆傳至腎臟,引發腎後性氮血症、高血鉀與代謝性酸中毒,膀胱持續膨脹可導致膀胱壁缺血壞死甚至破裂,屬危及生命狀況。
兔腎臟疾病為家兔的腎元進行性損傷,最具特徵的病因是 Encephalitozoon cuniculi 微孢子蟲引起的肉芽腫性間質性腎炎,另含上行性細菌性泌尿道感染、腎結石與年齡相關退化。腎臟濃縮與排泄功能下降後,早期表現為多飲多尿,隨腎功能惡化而累積含氮廢物,進展為氮血症與尿毒症(脫水、虛弱、口腔潰瘍、體重減輕)。由於兔特殊的鈣代謝(過量鈣經尿液排除),易併發高鈣尿、尿砂與腎/輸尿管結石,使病程更為複雜。
兔尿泥症是因兔獨特的鈣代謝（腸道鈣吸收與飲食鈣含量成正比、過量鈣經腎臟以碳酸鈣排入尿液）使尿中碳酸鈣結晶過度沉澱，於膀胱底部聚積成黏稠膏狀「尿泥」的疾病。沉積物刺激膀胱黏膜引發膀胱炎、血尿與排尿疼痛，可進一步固化為膀胱結石或阻塞尿道。常見於飲食鈣過高、飲水不足、肥胖或活動量低的寵物兔。
兔泌尿道中形成結石的疾病，兔因獨特的鈣代謝方式（腸道吸收鈣與飲食鈣攝入量成正比，主要經腎臟排泄）而特別容易發生。結石多為碳酸鈣成分，好發於膀胱及輸尿管。
腎發育不良是一種先天性腎臟發育異常疾病，特徵為腎臟組織分化不完全，含有與發育階段不相符的結構。常見於幼犬，受影響動物多在年幼時即出現慢性腎衰竭症狀。
腎小管功能障礙導致無法正常酸化尿液或回收碳酸氫鹽，引起非氮質血症性高氯代謝性酸中毒的一組腎臟疾病。犬貓罕見但臨床重要。
腎小管間質性腎炎是以腎小管與腎間質炎症為主的腎臟疾病，與腎絲球疾病相比，蛋白尿較輕但腎功能損害可能更快。可為急性或慢性。
尿道完全或部分阻塞導致無法正常排尿的急診狀態，公貓最常見。完全阻塞超過 24-48 小時可因高血鉀心律不整與腎後性氮質血症致命。
尿道壁完全或部分撕裂,導致尿液外滲至周圍組織或皮下,常見於骨盆骨折、導尿創傷或嚴重尿道阻塞,為泌尿系統急症。
細菌定植於泌尿道（通常為膀胱）引起的感染性疾病，犬常見，貓年輕時罕見但老年貓較多。需區分單純性與複雜性感染以決定治療策略。
泌尿道中礦物質結晶過飽和沉積形成結石 (尿石)，可發生於腎臟、輸尿管、膀胱或尿道，以草酸鈣與磷酸銨鎂 (struvite) 結石最常見。中老年小型犬與成年貓好發，臨床重要性在於結石種類決定治療方式 (可溶解 vs 必須移除)，且公犬貓的尿道結石一旦完全阻塞，會在 24-48 小時內造成腎後性氮血症與致命高血鉀，是小動物急診中最常見的可逆性死因之一。
膀胱內尿液逆流至輸尿管甚至腎盂,可為先天性輸尿管瓣膜功能異常或後天性膀胱功能障礙所致,常導致反覆腎盂腎炎及腎功能損害。